在雙抬頭模式下，對于村股份公司通過分成方式取得物業(yè)，在分房過程中由于未發(fā)生產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移，村股份公司與項目公司均無需繳納增值稅、土地增值稅、企業(yè)所得稅、契稅。對于需對外銷售部分的物業(yè)，由項目公司直接分房后對外銷售，該部分稅金不重復繳納。相關政策依據(jù)如下所示：

根據(jù)國家稅務總局關于印發(fā)《營業(yè)稅問題解答（之一）的通知》（國稅函發(fā)〔1995〕156號）第十七條的規(guī)定，合作建房分房自用時出地方、出資方均需繳納增值稅（營改增前為繳納營業(yè)稅）。

需注意：深圳地區(qū)有例外規(guī)定，參照《深圳市地方稅務局關于合作開發(fā)房地產(chǎn)征收營業(yè)稅問題的批復》（深地稅發(fā)〔2005〕183號）規(guī)定，分房自用時出地方、出資方目前均無需繳納增值稅（營改增前為無需繳納營業(yè)稅）。

根據(jù)《深圳市地方稅務局關于合作開發(fā)房地產(chǎn)征收營業(yè)稅問題的批復》（深地稅發(fā)〔2005〕183號）相關內(nèi)容：

你局《關于合作開發(fā)房地產(chǎn)征收營業(yè)稅問題的請示》（深地稅三發(fā)〔2004〕137號）收悉。對擁有土地使用權(quán)的一方，為實現(xiàn)合作開發(fā)而引進其他合作方，經(jīng)國土管理部門批準由各方共同開發(fā)房地產(chǎn)項目的營業(yè)稅征稅問題，經(jīng)研究，現(xiàn)明確如下：

合作建房過程中是否發(fā)生國家稅務總局《關于印發(fā)〈營業(yè)稅問題解答（之一）的通知〉》（國稅函發(fā)〔1995〕156號）第十七條所指的“一方以部分土地使用權(quán)為代價換取部分房屋所有權(quán)，另一方以部分房屋所有權(quán)為代價換取部分土地使用權(quán)”的應稅行為，是依據(jù)土地使用權(quán)或房屋所有權(quán)是否發(fā)生轉(zhuǎn)移來確定的，當土地使用權(quán)或房屋所有權(quán)發(fā)生轉(zhuǎn)移時，應征收相應的營業(yè)稅，否則不予征稅。

2004年7月31日，深圳市國土資源和房產(chǎn)管理局《關于合作建房涉及的兩個問題的復函》（深國房函〔2004〕94號）對我局提出的合作建房過程中土地使用權(quán)歸屬問題作了明確，即合作建房過程中，先取得土地使用權(quán)的一方，聯(lián)同其他合作方共同與規(guī)劃和自然資源部門簽訂的土地使用權(quán)出讓合同書補充協(xié)議與原合同享有同等的法律效力，受讓各方在簽訂合同及其補充協(xié)議并付清土地使用權(quán)出讓金和土地開發(fā)與市政配套設施金后，即共同擁有土地使用權(quán)。不存在一合作方向另一合作方轉(zhuǎn)移土地使用權(quán)的行為。

因此，凡在2004年7月31日以后采用這種方式合作建房的，不征收“以地換房”、“以房換地”環(huán)節(jié)的營業(yè)稅，2004年7月31日之前（含31日）已發(fā)生的同類合作建房行為，未征稅的不再補征，已征的營業(yè)稅不再退還。

留用地“雙抬頭”模式下的物業(yè)分配實則為村股份公司與開發(fā)商在共有土地使用權(quán)上自建房后的分配問題。因此，分成物業(yè)將依據(jù)土地出讓合同和不動產(chǎn)權(quán)證所約定的份額由規(guī)自局進行直接初始確權(quán)。從業(yè)務形式和稅收法律事實的角度來看，該模式下分成物業(yè)不存在產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移問題，故稅收征管中不作為銷售處理。所以無論對于村股份公司還是開發(fā)商，初始確權(quán)環(huán)節(jié)均不涉及稅收的問題。只有各自對外銷售環(huán)節(jié)（尤其是社區(qū)股份公司以分紅形式分配給股民）才會對應涉及增值稅及附加稅、土地增值稅、企業(yè)所得稅、印花稅和買方契稅等稅收征納問題。

合作建房情形下按比例分房環(huán)節(jié)可暫免征收土地增值稅，只需在納稅申報時填寫“合作建房自用的土地增值稅減免”，同時附送房屋產(chǎn)權(quán)證、土地使用權(quán)證明，合作建房合同（協(xié)議），房產(chǎn)分配方案相關材料，提交其他減免稅相關資料。

根據(jù)《財政部、國家稅務總局關于土地增值稅一些具體問題規(guī)定通知》（財稅〔1995〕48號）規(guī)定：第二條 對于一方出地，一方出資金，雙方合作建房，共同投資、共擔風險、共享利潤，建成后按比例分房自用的，暫免征收土地增值稅；建成后轉(zhuǎn)讓的，應征收土地增值稅分房過程中的所得稅。

村股份公司和項目公司各自作為房地產(chǎn)開發(fā)項目獨立的納稅主體，應分別單獨計征企業(yè)所得稅，不應將項目的收入、成本、費用歸集在其中一方賬務下，合并計入該方的應稅所得。而應采取類似合伙企業(yè)“先分后稅”的原則，分房之后各自計算本方取得的收入，各自計算本方支出的成本。合作建房后分房自用按自建房處理，因此分房過程不產(chǎn)生所得稅的納稅義務。

合作建房第一步開發(fā)商通過與村股份公司、規(guī)自局簽署補充協(xié)議的方式“加名”，將土地使用權(quán)登記到雙方名下，出地方并未發(fā)生土地、房屋權(quán)屬變更，出地方取得該土地使用權(quán)無需繳納契稅，出錢方則屬于土地、房屋權(quán)屬變更的承受單位，應征收契稅，其計稅依據(jù)為出錢方取得土地使用權(quán)的對應承擔價格。合作建房并各自分得房屋辦理初始登記時，不發(fā)生權(quán)屬轉(zhuǎn)移，對出地方、出錢方均不征收契稅。

根據(jù)《中華人民共和國契稅暫行條例》（國務院令第224號）規(guī)定：在中華人民共和國境內(nèi)轉(zhuǎn)移土地、房屋權(quán)屬，承受的單位和個人為契稅的納稅人。